医院重点发展专科之一，设置床位20张。科室与东部战区总医院及江南大学附属医院开展全面合作，由特聘专家进行全程技术指导。 科室配置有独立消化内镜中心，占地约400平方米。配备奥林巴斯cv-290电子胃肠镜系统、爱尔博氩气高频电刀、科曼麻醉机、飞利浦监护仪等高端设备。擅长消化道常见疾病的诊治，包括胃食管反流病、幽门螺旋杆菌感染、萎缩性胃炎、慢性腹痛腹泻、便秘等。开展胃食管、结直肠疾病（炎症、溃疡、出血、息肉、早期肿瘤等）的内镜下诊断及治疗，内镜下息肉切除术及内镜下黏膜切除术（EMR）等操作。